Creo que son varios:

-El primer duelo con K.Roll en DKC3, ya que es muy dinámico, no es solo golpear al jefe en la cabeza despues de moverse de aqui para allá xD

-Tabuu de SSBB, es un poco dificil :S pero es bueno, en verdad debes ser muy hábil para derrotarlo

-No podía faltar el Bowser de SMB3, simplemente genial, algo fácil y aburrido, pero épico.

Hmm... para mí el mejor es Neo Cortex de Crash Bandicoot 3.

Video: En 02:26 empieza

No lo quise explicar porque es un poco complicado de hacerlo. Para mí es el mejor que he visto hasta ahora.

Yoshi Island: Baby bowser me encanta el fondo y cuando se tiene que derrotar abentando huevos gigantes.

Los mios tambien son varios:

1.- Kirby 64: The Cristal Shards - O² El jefe es epico, la musica igual, es uno de los mejores del juego, aunque no tenga una variedad de ataques, me gusta que sea dificil de derrotar, aunque lo venzo como si nada

2.- Star Fox Assault - Aparoid Queen. El ultimo jefe(a) del juego, es epico(a), me gusta la batalla por que se divide en varias partes y tienes que pasar por miles de obstaculos antes de llegar a ella y casi siempre llegas con menos de media vida, lo que lo hace divertido, tambien me gusta la musica y que tus compañeros te ayuden en la segunda parte, aunque a veces no logro que ni uno se retire, ¡la batalla(s) es(son) epica(s)!

3.- Luigi's Mansion - King Boo & Bowser. Como dejar atras la epica batalla del jefe final de Luigi's Mansion. Esta batalla me gusta porque todos los ataques de Bowser son letales, te bajan mucha vida, ademas de eso, King Boo tiene 500 puntos de vida, los cuales bajan muy rapido . ¿Y quien dijo que la musica no es epica?, toda la musica del juego es simplemente... ¡Epica!

4.- Metal Slug 5 - Final Boss (No recuerdo el nombre). Este jefe es... ¡un dolor de huevos vencerlo sin morirme ni una sola puta vez! y tambien me ha gustado por la dificultad, la musica y todo. La variedad de ataques de este jefe es moderada, ya que aprendes a esquivarlos, todo se vuelve facil.

5.- Touhou 13: Ten Desires - Toyosatomimi no Miko. ¡Si! Esta batalla me gusta, me gusta la dificultad que tiene, la musica y todo... esa batalla se ha vuelto una de mis favoritas, me gusta practicar en ese stage.

Nota: Los jefes estan ordenados asi, del que mas me gusta al que menos me gusta de mis jefes favoritos.

Sonic & Kuckles
este jefe es uno de mis favoritos... ya no se encuentran jefes asi.. aunque es algo facil

Sonic 2 - Silver Sonic + Death Egg Robot esto son un reto por no tener ni un anillo

Megaman 7 jo.. este fue un reto la primera vez que lo jugue (mas en la segunda etapa)


y aun hay mas.. pero ahorita o me acuerdo .-.